Bioinformatique fongique

Je travaille sur la diversité fongique avec la description de nouvelles espèces, la taxonomie et la phylogénie fongique, le métabarcoding, ainsi que l’évaluation de la toxicité fongique en Afrique de l’Ouest. De plus, j’étudie l’effet du changement climatique sur la communauté microbienne du sol.

Je suis pédologue et écologiste agronome et je suis infiniment émerveillé par l’environnement, sa beauté et son immensité. Mes recherches visent en particulier à comprendre les mécanismes et les réponses biologiques et physiologiques sous-jacents des plantes à la relation de cause à effet entre les plantes et les microbes, en particulier les CMA.

Je travaille sur la façon dont les changements environnementaux tels que l’expansion des forêts ou le mouvement de la limite des arbres ont un impact sur les communautés microbiennes souterraines et leur rôle dans les processus écosystémiques

Taxonomie, biodiversité, métabarcodage de la diversité des fougères et des mycorhizes.

Mes recherches portent sur la dynamique spatiale et temporelle des communautés fongiques et d’arthropodes dans les milieux anthropiques. En utilisant le séquençage à haut débit et en collaborant avec des citoyens scientifiques, nous visons à améliorer notre compréhension de la distribution microbienne, à identifier les facteurs influents et à démêler les interactions complexes entre divers taxons microbiens au sein des écosystèmes urbains et ruraux.

Ma thèse de doctorat vise à comprendre l'influence des applications de Biochar et de Biochar-engrais sur la diversité des champignons mycorhiziens à arbuscules indigènes, la solubilisation du phosphore et la croissance du maïs dans les comtés de Kwale (zones côtières semi-arides avec ferralsols) et d'Embu (zones de hautes terres avec nitisols humiques) au Kenya.

Je suis chercheur postdoctoral à l'ETH Zurich et au SPUN, et je travaille avec des modèles à l'échelle mondiale pour mieux comprendre l'écologie et la distribution des champignons dans le monde. Je travaille également avec l'ADN électronique des sols pour améliorer notre compréhension de la façon dont les communautés fongiques influencent les écosystèmes forestiers (en particulier avec les champignons ectomycorhiziens), ainsi qu'avec des expériences en serre (impliquant à la fois l'ectomycorhize et les mycorhizes éricoïdes).

J'explore les associations mycorhiziennes et fixatrices d'azote en cartographiant la diversité des guildes symbiotiques des arbres et de leurs partenaires fongiques et bactériens dans les forêts australiennes. Mes recherches s'étendent de l'échelle nationale (toutes les forêts) à l'échelle biorégionale (forêts tempérées à larges feuilles). Mon objectif est d'identifier les points chauds de la diversité et les principales menaces que le changement global fait peser sur ces partenariats vitaux.

Niloufar Hagh Doust est une écologiste qui s'intéresse particulièrement à l'écologie fongique, à l'écologie forestière, à l'écologie des communautés, aux interactions plantes-microbes, aux symbiotes bénéfiques, au changement climatique et au cycle du carbone et des nutriments. Ses recherches portent principalement sur l'écologie des microbes associés aux plantes (en particulier les champignons) et leurs avantages potentiels pour la sylviculture et l'agriculture.

Mes recherches portent principalement sur les espèces d’ectomycorhiziens comestibles et sur la façon dont nous pouvons développer la culture de ces nouvelles cultures. D’autres sujets incluent : la réponse des espèces au changement climatique, les assemblages de communautés, l’interaction/dépendance entre différentes espèces et la distribution du matériel génétique dans le temps et l’espace (par exemple, les interactions mycophagies).

J'étudie les champignons AM, d'anciens champignons biotrophes essentiels à l'absorption des nutriments par les plantes. Malgré leur importance, leur génétique reste insaisissable. J'ai mis au point un protocole d'isolement d'un seul noyau pour combler cette lacune. En outre, j'explore la symbiose mycorhizienne chez Parasponia-Trema, qui est parallèle à la symbiose des nodules, afin de comprendre l'évolution des traits symbiotiques dans les relations plantes-microbes.

Mes recherches portent sur l’impact des mégaherbivores domestiques et sauvages sur la dynamique mycorhizienne et l’équilibre carbone des écosystèmes dans les systèmes tropicaux et boréals. J’applique des méthodes à l’écologie des sols, à la biogéochimie, à l’écologie des écosystèmes et à la biologie de la conservation pour évaluer comment les animaux interviennent dans les processus aériens et souterrains et peuvent être intégrés dans des solutions climatiques fondées sur la nature.

Mes recherches portent sur l’écologie des communautés mycorhiziennes dans le contexte des changements climatiques. En utilisant le séquençage à haut débit, j’essaie de comprendre la diversité naturelle des champignons mycorhiziens arbusculaires, de démêler leurs réponses aux changements climatiques et de découvrir leurs fonctions écologiques cruciales dans ces environnements changeants.