protocole d'échantillonnage

procédure

1. Naviguez jusqu'au site d'échantillonnage et placez deux transects à angle droit pour délimiter une zone d'échantillonnage de 900 m2 (30 m x 30 m). 9 sous-échantillons (5 cm de diamètre à 10 cm de profondeur) seront prélevés. Voir la figure pour le plan d'échantillonnage global. Au total, vous devrez combiner 9 échantillons de la même parcelle dans le sac en plastique. La grille peut être redimensionnée pour les études portant sur l'échantillonnage de sites plus petits qui ne peuvent pas entrer dans une grille de 30 m x 30 m, bien que la taille préférée soit de 30 m x 30 m.
2. Remplissez la fiche de métadonnées.
   A. Notez le pays d'échantillonnage, le nom du chef d'expédition et des collaborateurs.
   B. Classez l'utilisation du sol du site (par ex. petite ferme, non agricole, urbain, brûlé).
   C. Enregistrez les coordonnées GPS (WGS1984) à l'aide d'un appareil GPS et idéalement en format décimal (par ex. -39.5818, -71.51917).
   D. Estimez grossièrement le nombre d'espèces végétales présentes et le % de couverture des arbres par rapport à l'herbe/aux plantes plus petites. Il est important de documenter les plantes ectomycorhiziennes et les plantes mycorhiziennes éricoïdes (Ericaceae). Si les noms des plantes sont connus, notez-les.
   E : Notes finales : notez tout ce qui n'est pas mentionné ci-dessus.
3. Mettez des gants. Retirer la couche de litière (matériau meuble) du point central.
4. Au premier point central, enregistrez l'altitude et les coordonnées GPS à l'aide d'un appareil GPS.
5. Prélevez le premier échantillon à partir de ce point central (5 cm de diamètre à 10 cm de profondeur) à l'aide du carottier et placez le sol dans le grand sac en plastique. Retirez les grosses racines et les pierres à la main (ou à l'aide d'un tamis, si vous préférez). Inscrivez au marqueur sur chaque sac le nom du lieu d'échantillonnage, les coordonnées GPS, la date et le nom du collecteur. Prenez une photo de chaque sac.
6. Dans chaque direction cardinale à partir du point central, mesurez 15 m et prélevez 4 échantillons supplémentaires après avoir enlevé la litière. Effectuez ensuite un carré complet pour collecter les 4 échantillons restants (voir figure). Il devrait y avoir 9 sous-échantillons au total.
7. Frottez l'extérieur du sac avec vos mains, mélangez les échantillons soigneusement mais délicatement afin que le sol devienne un mélange homogène. Le mélange doit durer au moins 2 minutes pour assurer une homogénéisation suffisante.
8. Traiter les échantillons de sol en fonction des conditions du terrain (humide ou sec) :
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   Pour les sols secs: Prélever un sous-échantillon de 10 à 20 grammes dans le plus petit sac (ou tube) et ajouter un sachet de thé propre contenant 10 à 20 grammes de gel de silice au sac/tube de sol. Si vous le souhaitez, conservez les échantillons au réfrigérateur avec de la glace ou des blocs réfrigérants dans une glacière de terrain. Si vous effectuez une collecte de plusieurs jours et que vous n'avez pas accès à la réfrigération, vous pouvez sécher les échantillons à l'air libre ou continuer à remplacer le gel de silice si nécessaire. Ne congelez pas les échantillons sur le terrain, car nous voulons éviter l'impact de la congélation et de la décongélation à plusieurs reprises pendant le transport.
   
   ‍Pour lessols humides: Prélever un sous-échantillon de 10 à 20 grammes dans le plus petit sac (ou tube), le conserver sur de la glace ou des blocs réfrigérants sur le terrain. Réfrigérez en fin de journée (si possible) jusqu'à ce que vous atteigniez le lieu de stockage final. Ne congelez pas les échantillons sur le terrain, car nous voulons éviter l'impact de la congélation et de la décongélation à plusieurs reprises. Si la réfrigération n'est pas possible, utilisez le même protocole que celui suggéré pour le sol sec.
9. Naviguez jusqu'au site d'échantillonnage suivant et répétez les étapes 1 et 2. Au nouveau site, confirmez que vous êtes à au moins 1,2 km (distance suggérée) de votre site d'échantillonnage précédent, en utilisant votre appareil GPS.
10. Effectuez un "lavage du sol" sur la carotte de sol afin d'éliminer le sol de l'emplacement précédent. Pour ce faire, vous devez prélever une carotte de sol dans la zone d'échantillonnage et la jeter sur le sol.
11. Répéter l'opération jusqu'à ce que tous les sites aient été collectés.
12. Dès que possible, les échantillons doivent être placés à -20 ºC ou -80 ºC pour être conservés jusqu'à ce que l'ADN puisse être extrait.