Les forêts boréales de Mongolie se trouvent à la limite sud de la taïga et constituent une transition vers le biome forêt-steppe. Ces forêts, composées principalement de mélèzes de Sibérie (Larix sibirica), de pins de Sibérie (Pinus sibirica), de pins sylvestres (Pinus sylvestris), de pins blancs du Japon (Betula platyphylla) et d'épicéas de Sibérie (Picea obovate), connaissent des températures hivernales extrêmement basses avec un gel profond du sol, et sont fortement limitées par les précipitations.

Il existe peu d'études publiées sur les communautés ectomycorhiziennes dans les forêts mongoles. Cependant, des études menées dans d'autres biomes ont montré que certains genres d'arbres ont une gamme étroite de taxons ectomycorhiziens. Dans ce projet, nous étudierons les communautés ectomycorhiziennes dans les forêts mixtes et monospécifiques de la zone protégée de Bogd Khan, à Umnudelger, Binder soum, province de Khentii, et dans le site du patrimoine mondial de Burkhan Khaldun. Alors que la zone protégée de Bogd Khan est proche d'Oulan-Bator, le site du patrimoine mondial de Burkhan Khaldun est une zone vierge éloignée. Sur ces sites, nous collecterons des sols et des racines fines, et nous évaluerons la communauté ectomycorhizienne dans les sols en utilisant la métagénomique. La communauté ectomycorhizienne sur les racines fines sera évaluée en morphotypant les ectomycorhizes, et l'identification finale en utilisant les séquences d'ADN. Nous prévoyons que, dans ces conditions extrêmes, un certain nombre de taxons ectomycorhiziens uniques seront identifiés. Le projet sera réalisé à l'Université des sciences de la vie de Mongolie et à l'Institut d'écologie forestière de BOKU, à Vienne.

Les écosystèmes forestiers tropicaux conservent les plus hauts niveaux de biodiversité, ce qui en fait de grands contributeurs à la biodiversité totale de la Terre. Le Mont Mabu est une montagne située dans le nord du Mozambique d'environ 1700 mètres couvrant approximativement plus de 7000 hectares. On estime que le mont Mabu est la plus grande forêt pluviale de moyenne altitude d'Afrique, abritant une faune diverse, inconnue des scientifiques. Jusqu'à présent, seule la végétation des pentes inférieures du sud-est a été décrite - bois, forêt et broussailles/plaques de roseaux sur la roche nue, le reste étant inconnu. Les champignons mycorhiziens, un groupe très important de micro-organismes du sol, sont présents dans de nombreux habitats mais les connaissances concernant leur présence dans les régions tropicales sont encore rares. Les structures de leurs communautés sont diverses entre les montagnes à différentes altitudes, en particulier dans les forêts tropicales humides. On s'attend donc à ce que le mont Mabu, en tant que forêt inexplorée, puisse représenter un hotspot pour de nombreuses espèces, y compris les micro-organismes du sol tels que les champignons mycorhiziens. Pour y remédier, l'échantillonnage, les efforts de collaboration et l'utilisation de méthodologies moléculaires sont encouragés. Notre projet a pour but d'échantillonner et d'isoler les champignons mycorhiziens en utilisant des techniques morphologiques et moléculaires et enfin d'essayer de les cultiver en laboratoire.

Les interactions plantes-fongiques, telles que la symbiose mycorhizienne, sont des déterminants majeurs de la taille de l'aire de répartition biogéographique des plantes, de la dynamique des populations et de la composition des communautés végétales. Dans les écosystèmes forestiers tropicaux des îles océaniques, les communautés végétales indigènes et endémiques ont tendance à être remplacées par des communautés végétales introduites et invasives, ce qui entraîne des changements importants dans l'étage supérieur, le sous-étage et le sol forestier. Cependant, dans ces régions du monde, l'impact des invasions biologiques sur la biodiversité fongique du sol est peu documenté. Dans ce projet, nous proposons (1) de réaliser un inventaire moléculaire des champignons du sol dans les forêts humides de Mo'orea, une des îles hautes de la Polynésie française et (2) d'évaluer l'impact des plantes envahissantes Miconia calvescens et Spathodea campanulata sur ces communautés fongiques.

L'inventaire taxonomique des espèces fongiques sera basé sur des techniques de séquençage à haut débit de l'ADN ribosomal (métabarcoding). Il sera réalisé sur de l'ADN extrait des sols de la forêt pluviale de haute altitude dite " forêt nuageuse " et dans la forêt mésophile de basse altitude sur un site expérimental classé zone naturelle d'intérêt écologique et patrimonial (ENIEP d'Opunohu). Une meilleure connaissance des communautés fongiques dans les sols forestiers et les racines des arbres endémiques devrait nous informer sur les effets des communautés microbiennes fongiques sur la vulnérabilité et la résilience des forêts tropicales humides aux invasions végétales, dans un contexte de changement climatique.

Le projet vise à produire des données de haute qualité sur la diversité et l'abondance du mycobiome du sol dans les plantations de cacao de Côte d'Ivoire. La Côte d'Ivoire (Afrique de l'Ouest) est le plus grand producteur de cacao (Theobroma cacao) au monde avec trois régions de production (Est, Centre-Ouest, et Sud-Ouest). Les plantations de cacao sont soumises à différents régimes de gestion, y compris des systèmes agroforestiers à proximité de forêts denses naturelles. Nous avons émis l'hypothèse que les plantations soumises à un régime de gestion à long terme (anciennes plantations) ont une structure altérée du mycobiome du sol qui a conduit à une diminution de la diversité des champignons du sol. Trois régimes de gestion différents (+ forêts naturelles) provenant de quatre sites du projet CacaoSAF en cours (Alliance Bioversity - CIAT), seront considérés. Sur chacun des 14 sites d'échantillonnage, des carottes de sol composite et des racines fines seront prélevées sur un total de 10 cacaoyers et sur l'arbre le plus dominant dans les forêts denses. La dépendance mycorhizienne et l'identification et la densité des spores d'AMF seront effectuées à l'Université de Parakou au Bénin. Un double d'échantillons de sol sera envoyé à l'Université agricole de Suède pour le métabarcodage (NGS). Des entretiens semi-structurés seront menés avec les agriculteurs du projet CacaoSAF afin de recueillir des informations sur l'âge de la plantation, le régime de gestion, la productivité dans le temps et la forêt naturelle. Pour chaque échantillon, nous remplirons le formulaire de métadonnées. A la fin du projet, les agriculteurs du projet CacaoSAF pourront apprécier comment leurs pratiques de gestion affectent le mycobiome du sol. Les scientifiques partenaires de l'Institut National Polytechnique Félix Houphouët-Boigny bénéficieront des données moléculaires et de l'identification des AMF des cacaoyers de Côte d'Ivoire. Nous espérons générer au moins un article dans une revue d'écologie appliquée ou dans une revue sur la diversité des organismes. Les données de séquence générées seront partagées avec l'outil CacaoSAF développé par l'Alliance Bioversity-CIAT, ainsi que sur des plateformes internationales accessibles.

La région amazonienne possède un grand nombre d'écosystèmes, qui abritent une grande diversité biotique. Elle est considérée comme un hotspot pour les champignons du sol et protège un haut niveau d'endémisme fongique (Tedersoo et al. 2014, 2022). Le projet prévoit d'étudier les communautés fongiques du sol, y compris les mycorhizes à arbuscules et les ectomycorhizes, en trois points contrastés et distants de l'Amazonie colombienne, ce qui nous permettra d'en savoir plus sur les schémas de distribution des communautés fongiques du sol, et en particulier des mycorhizes. En plus de l'étude des forêts de sable blanc et des forêts de terra firme, les forêts des plaines alluviales ou várzea seront incluses, qui n'ont pas encore été étudiées.

L'Uruguay fait partie des prairies subhumides tempérées de la partie orientale de l'Amérique du Sud. Notre territoire est décrit comme Campos au sein du Biome Pampa selon des caractéristiques physionomiques, géomorphologiques et édaphiques. Cette région présente une activité photosynthétique tout au long de l'année et représente l'une des zones de prairies les plus diverses, les plus vastes et les moins transformées du monde. Malgré leur apparente homogénéité physionomique, ces prairies présentent une grande diversité d'espèces, les graminées étant la forme de vie dominante, à l'exception de quelques arbustes et arbres épars. Actuellement, l'Uruguay a perdu 10% de ses pâturages. Un travail de cartographie régionale du biome de la Pampa (Brésil, Argentine et Uruguay) montre la réduction de l'écosystème des prairies en deux décennies. Le principal facteur de perte de pâturages dans notre pays est l'agriculture, suivie par la sylviculture et les plantes envahissantes.

Le rôle clé des champignons mycorhiziens à arbuscules (AMF) dans les écosystèmes terrestres est largement reconnu, car ils régulent les cycles des nutriments et du carbone, influençant la structure du sol, la communauté végétale et la multifonctionnalité de l'écosystème. Le rôle de la symbiose mycorhizienne a été généralement lié à son impact sur la nutrition minérale des plantes. Cependant, il a été démontré que ce processus symbiotique a un rôle clé dans la stabilité et la restauration des écosystèmes. L'AMF est un micro-organisme mutualiste qui relie les composantes biotiques et abiotiques des écosystèmes, en jouant un rôle de médiateur dans la compétition végétale et la distribution des nutriments. Notre question est la suivante : dans la région de Campos, quels sont les facteurs qui déterminent et modulent la biodiversité des MA ? Quatre sites représentant des prairies conservées seront échantillonnés ; nous combinerons différentes approches pour comprendre la diversité des MA en examinant les liens entre les MA et la structure des communautés végétales, la géochimie et les interactions des communautés microbiennes du sol.

Trois hypothèses sont proposées : (1) la diversité des AMF est affectée par le type de sol et les conditions environnementales physico-chimiques ; (2) la diversité des AMF répond aux changements de la diversité de la communauté végétale aérienne ; et (3) la diversité des AMF est affectée par les interactions avec les communautés microbiennes du sol (champignons et bactéries) qui coexistent dans le même site.

Au cours de ce projet, la motivation des communautés locales se fera par le biais de séminaires et de conférences. Les communautés locales, en particulier les élèves des écoles rurales, pourraient garder les communautés végétales sous observation dans le cadre de mini-projets de conservation passive et de restauration visant à les impliquer dans un changement d'état d'esprit concernant la santé des sols et la biodiversité souterraine et aérienne.

Le but de ce projet est de comprendre si les plantes invasives non indigènes sont capables de déplacer avec succès leurs congénères indigènes en interagissant avec leurs symbiotes obligatoires indigènes : les champignons ectomycorhiziens. Le projet se déroulera dans la région orientale de la Patagonie, en Argentine, un écosystème de steppe, dominé par des plantes herbacées et arbustives xérophiles. Même si la steppe est l'écosystème dominant dans le cône sud de l'Amérique du Sud, les études du sous-sol dans les zones sèches de Patagonie sont sous-représentées par rapport aux forêts tempérées des Andes. Nous échantillonnerons le sol sous des populations riveraines indigènes et non indigènes envahissantes de Salix spp. (saules). Ces espèces d'arbres sont les seuls hôtes ectomycorhiziens dans cet habitat, qui constitue la limite de leur distribution méridionale, où les mutualismes devraient être essentiels pour leur établissement et leur survie. Étudier si les espèces végétales envahissantes peuvent interagir avec les champignons indigènes et les changements potentiels dans la communauté fongique indigène provoqués par les invasions, permettra de faire la lumière sur les impacts souterrains des invasions de plantes dans la steppe, jusqu'alors négligés, et ouvrira de nouvelles possibilités de gestion, contribuant à prévenir les pertes économiques et de biodiversité. Nous travaillerons activement avec les parties prenantes locales, le secteur privé et les communautés locales et autochtones, en les sensibilisant à la composante fongique des invasions et en les encourageant à s'impliquer dans l'idée que les champignons peuvent également être envahissants et que nous devons protéger les champignons indigènes de la dégradation.

Le Népal est un pays qui présente un gradient d'altitude abrupt, allant de 50 à 8848 mètres au-dessus du niveau de la mer, vers le nord, ce qui entraîne un climat et une formation d'habitats contrastés. Ce changement d'altitude et de climat permet la formation d'habitats diversifiés et la diversité de la flore et de la faune varie considérablement d'une région à l'autre. En outre, dans le gradient est-ouest, le régime des précipitations varie considérablement dans le pays. Pendant la saison de la mousson (juin-août), de fortes précipitations se produisent dans les régions de l'Est et la région de l'Ouest reçoit moins de précipitations. En hiver, la région occidentale reçoit plus de précipitations que la région orientale. Cependant, les précipitations totales de la saison hivernale sont inférieures à celles de la mousson. Cela crée un régime d'humidité du sol différent dans les régions Est-Ouest. Par conséquent, le gradient d'altitude et de climat vers le nord et le gradient de précipitations vers l'est et l'ouest font du Népal un pays riche en points chauds de la biodiversité de la flore et de la faune (au-dessus du sol), mais les points chauds de la biodiversité du sol (en dessous du sol) restent à déterminer. Nous supposons que le changement du gradient d'altitude et des types d'habitat a modifié la biodiversité du sol. L'échantillonnage du sol à travers les gradients d'altitude, de climat et de précipitations nous aidera à élucider la diversité de la flore et de la faune du sol. Nous aurons également l'occasion de comprendre et d'évaluer la biodiversité du sol dans les zones d'altitude supérieure, ce qui est unique dans les paysages népalais. Actuellement, nous collectons des échantillons de sol (volontairement) dans chacune des zones physiographiques. Nous n'avons que trois sites appariés pour cette évaluation. Nous avons suivi les protocoles du réseau de biodiversité des sols (SoilBON) pour collecter, préparer, stocker et expédier les échantillons. Ces sites couvrent largement l'état de la biodiversité des sols du Népal mais sont limités à la couverture de tous les types d'habitats vers les régions Nord-Sud et Est-Ouest. Par conséquent, nous aimerions étendre nos sites d'échantillonnage de 3 sites jumelés à 18 sites jumelés supplémentaires et les résultats contribueront directement à la réserve d'échantillons de SoilBON.

Il s'agit d'un projet interdisciplinaire d'envergure nationale auquel participent plus de 30 scientifiques de l'UNAM (Université nationale autonome du Mexique). Il fait partie du programme universitaire d'études interdisciplinaires des sols (PUEIS) développé principalement à l'Institut de biologie, à l'Institut d'écologie, à la Faculté des sciences et à la Faculté d'enseignement supérieur d'Iztacala.

Le sol constitue l'interface écologique qui abrite la plus grande biodiversité des écosystèmes terrestres. Le sol régule les cycles biogéochimiques mondiaux, soutient la diversité, l'activité et la productivité biologiques, et fournit les nutriments nécessaires à la croissance des plantes. Un sol préservé est un sol biodivers qui maintient des fonctions écologiques telles que l'activité microbienne, la minéralisation du carbone et de l'azote et l'activité enzymatique. Malgré l'importance du sol, cette ressource n'est pas renouvelable, et sa conservation est menacée par une mauvaise gestion et l'absence de stratégies de communication efficaces à son sujet. Au Mexique, 45% du territoire a des sols dégradés, ce qui signifie qu'ils ont perdu la capacité de maintenir leur fonction écologique, leur biodiversité et leur productivité. Une partie du problème réside dans le manque de données et d'informations sur la biodiversité et la fonction des sols dans de vastes zones géographiques du Mexique pour renforcer la prise de décision visant à leur gestion durable.

L'Atlas de la biodiversité des sols du Mexique repose sur trois principes directeurs (recherche, enseignement et sensibilisation de la société), chacun ayant l'objectif suivant. Recherche - générer des connaissances de pointe en utilisant des bases de données publiques sur la biodiversité, des réseaux de collaboration et les technologies les plus modernes de séquençage de l'ADN afin de produire la plus grande quantité possible de connaissances dans les plus brefs délais et au moindre coût. Enseignement - Produire des éléments d'apprentissage pour les niveaux secondaire, universitaire et postuniversitaire afin de promouvoir la connaissance de la vie dans les sols mexicains et la nécessité de protéger cette ressource non renouvelable. Sensibilisation - Créer une interface pour l'affichage et l'analyse des données afin de fournir des informations aux décideurs qui encouragent des pratiques de gestion respectueuses de la diversité des sols, ainsi que des programmes pour leur conservation et leur surveillance.

L'idée de notre projet au sein du SPUN est de fournir des preuves de la biodiversité du mycobiome racinaire autour des arbres monumentaux qui forment l'épine dorsale de la réserve de biosphère des Carpates orientales. Des ONG polonaises nous ont fourni les coordonnées GPS de 3675 "arbres monumentaux" qui devraient être considérés comme les "points chauds" de la région, mais qui sont toujours exploités à un rythme alarmant.

Nous avons l'intention de soutenir l'initiative visant à inclure ces sites inestimables dans le parc national de Bieszczady. Par conséquent, nous voulons partager les données scientifiques avec les communautés activistes et artistiques en Pologne afin de parler plus fort de l'importance des réseaux mycorhiziens forestiers.

Humboldt a signalé que la richesse des espèces végétales tropicales diminuait avec l'augmentation de l'altitude et la diminution de la température. Les régions tropicales abritent la majorité de la biodiversité mondiale, mais, étonnamment, les schémas de la diversité végétale et fongique sur les montagnes tropicales n'ont pas encore été décrits. Alexander von Humboldt a fait l'ascension des volcans Chimborazo, Antisana et Pichincha en Équateur. Il a enregistré la distribution des espèces végétales et des zones de végétation le long de ses pentes et dans les parties environnantes des Andes. Nous proposons de suivre les étapes de ces trois expéditions de Humbold, en suivant un transect andin traversant 3,5 à 5 km d'altitude (équivalent à une gamme de températures annuelles moyennes de 6,5°-26,4°C) pour vérifier si les espèces fongiques du sol, en particulier les mycorhizes, la diversité et la composition suivent des modèles biogéographiques similaires avec des facteurs environnementaux partagés. Cette étude sera réalisée pour la première fois en Équateur. Avec l'aide des archives historiques de l'expédition de Humboldt.