SPUN travaille avec des chercheurs locaux pour développer des campagnes d'échantillonnage qui aident à caractériser la biodiversité mycorhizienne dans divers écosystèmes souterrains. Pour ce faire, nous combinons les données de séquençage de l'ADN mycorhizien géolocalisées avec des variables écologiques afin de générer des prévisions spatiales de la diversité mycorhizienne par le biais d'une approche d'apprentissage automatique. Cette approche nous permet de prédire les valeurs de la diversité mycorhizienne dans les divers écosystèmes et régions du globe. Ensuite, nous quantifions l'incertitude de ces prédictions et identifions les écorégions sous-échantillonnées afin d'orienter les futures recherches sur les mycorhizes. Afin d'améliorer la précision de nos modèles, nous vérifions nos prédictions sur le terrain en travaillant avec des chercheurs locaux pour échantillonner physiquement le sol dans les écosystèmes présentant les valeurs d'incertitude les plus élevées, telles qu'identifiées par nos modèles, puis nous les testons par rapport à nos prédictions. Avec chaque nouvelle série d'échantillons, nos modèles deviennent plus précis et nos valeurs d'incertitude diminuent.

Sur le terrain, SPUN travaille avec des scientifiques et des institutions locales pour identifier les sites d'échantillonnage sur lesquels des échantillons de sol seront prélevés. Les échantillons de sol sont prélevés selon un protocole standardisé qui garantit la cohérence de nos analyses. Vous pouvez consulter nos protocoles d'échantillonnage ici. Ces échantillons sont ensuite traités en laboratoire, où l'ADN est extrait des échantillons de sol, suivi de l'amplification spécifique de l'ADN des champignons arbusculaires et ectomycorhiziens. La région amplifiée de l'ADN mycorhizien est ensuite envoyée à un laboratoire de séquençage pour l'identification des espèces et lignées mycorhiziennes exactes dans l'échantillon. Ces données sont intégrées dans nos modèles, ce qui permet d'améliorer nos prévisions. Notre objectif est de générer des données utiles aux gouvernements, aux décideurs politiques, aux ONG et à d'autres acteurs, afin de contribuer à la diversification des programmes de conservation.

Pour en savoir plus sur nos expéditions, consultez les récits ci-dessous.