Glossaire

Champignons mycorhiziens à arbuscules

Les champignons mycorhiziens arbusculaires sont la forme ancienne et ancestrale de la symbiose mycorhizienne. Ces champignons ont joué un rôle clé dans le déplacement des ancêtres des plantes sur la terre ferme. Lorsque les premières racines sont apparues, l'association mycorhizienne avait déjà quelque 50 millions d'années.

Point chaud de la biodiversité

Un point chaud de biodiversité est une région unique qui est a) menacée par l'activité humaine b) contient au moins 1 500 plantes vasculaires endémiques que l'on ne trouve nulle part ailleurs et c) conserve 30 % ou moins de sa végétation d'origine.

Pipeline bioinformatique

Un pipeline bioinformatique utilise des algorithmes logiciels pour stocker, organiser et analyser les données biologiques relatives au séquençage génomique.

Biome

Une zone géographique définie par une flore et une faune distinctes. Les biomes sont caractérisés par des communautés biologiques et des espèces spécifiques qui se sont formées en réponse à l'environnement physique, tel que le type de sol et le climat. SPUN et ses partenaires s'efforcent de faire en sorte que les fongus soient inclus dans la définition des biomes. Les biomes sont constitués d'écorégions.

Séquestration du carbone

Le processus de fixation, de capture ou d'élimination du carbone de l'atmosphère et/ou de son stockage dans un réservoir de carbone. Il s'agit d'un processus naturel. Le dioxyde de carbone est un gaz à effet de serre qui contribue au changement climatique. Les champignons mycorhiziens contribuent à attirer le carbone dans les sols. 75 % du carbone terrestre est stocké sous terre. Le carbone est stocké dans les plantes, le sol, les océans et les champignons.

Science citoyenne

Collaboration entre des membres du grand public et des scientifiques dans le but de collecter et d'analyser des données sur le monde naturel.

Changement climatique

Changements à long terme des conditions météorologiques et des températures moyennes qui définissent le climat de la Terre. Les causes peuvent être naturelles ou anthropiques. La période actuelle de changement climatique (l'Anthropocène) est le fait de l'homme. Elle trouve son origine dans la révolution industrielle et la combustion de combustibles fossiles tels que le pétrole, le charbon et le gaz.

Extraction de l'ADN

L'extraction de l'ADN (acide désoxyribonucléique), réalisée pour la première fois en 1896, est le processus par lequel l'ADN est séparé et isolé des autres composants cellulaires. La SPUN utilise l'extraction d'ADN comme méthode pour isoler et identifier les souches mycorhiziennes présentes dans les échantillons de sol.

Ecorégion

Autre nom pour un écosystème, mais défini par la base de données RESOLVE. La biodiversité au sein des écorégions est plus similaire à l'intérieur de l'écorégion qu'à l'extérieur ou entre les écorégions. Les groupes d'écorégions constituent des biomes.

Écosystème

Un écosystème est formé par les interactions entre les organismes et leur environnement, et peut être de n'importe quelle taille. Les composants peuvent être à la fois biotiques (vivants) et abiotiques (non vivants). Les forêts, les prairies, les récifs coralliens, les déserts, les forêts tropicales et la toundra sont des exemples d'écosystèmes.

Biodiversité des écosystèmes

La biodiversité des écosystèmes fait référence aux variations entre les écosystèmes. Un écosystème est constitué de ses organismes, de leur environnement et des interactions entre les deux. La diversité des écosystèmes est l'étude des différents écosystèmes et des différents types de diversité, tels que la variation des espèces, la variation génétique et la variation fonctionnelle.

Champignons ectomycorhiziens

Les arbres de la plupart des forêts boréales et tempérées dépendent d'associations ectomycorhiziennes. Contrairement aux champignons mycorhiziens à arbuscules, les champignons ectomycorhiziens ne se développent pas dans les cellules des plantes ("ecto" signifie extérieur).

Funga

Funga désigne la diversité des communautés fongiques. C'est l'équivalent pour la faune et la flore du royaume des champignons. Le terme a été inventé et introduit en 2018 par Kuhar, Furci, Drechsler-Santos et Pfister.

Biodiversité fongique

La biodiversité fongique désigne la variété des champignons présents sur la planète. La biodiversité fongique peut être utilisée, par exemple, pour mesurer la qualité et la fertilité des sols.

Champignons

Fungi est le pluriel de fungus. Les champignons sont le groupe d'organismes eucaryotes connu collectivement sous le nom de royaume des champignons, qui comprend les champignons, les moisissures, les levures, les rouilles, les mildious et les charbons.

Moteur Google Earth

GEE (Google Earth Engine) est l'infrastructure nécessaire pour former, tester et lancer des modèles prédictifs mondiaux de la biodiversité et de la fonction mycorhizienne.

La vérité sur le terrain

La vérification sur le terrain est le processus qui consiste à obtenir, par des mesures directes, des faits concernant une situation donnée, par exemple les populations microbiennes du sol. Elle permet de vérifier l'exactitude des modèles et des prévisions par rapport aux conditions réelles observables. SPUN utilise des algorithmes pour générer des points chauds de biodiversité prédictifs, et la vérification sur le terrain pour vérifier si les modèles sont exacts.

Densité d'hyphes

La densité des hyphes dans les sols est une mesure importante de la quantité de mycélium produite à l'extérieur des racines des plantes par les champignons mycorhiziens dans les sols. Les réseaux d'hyphes denses retiennent davantage de carbone.

Métagénomique et métatranscriptomique

En microbiologie, la métagénomique étudie une communauté d'organismes, par exemple pour établir un profil taxonomique d'échantillons de sol et décrire la structure et la fonction des séquences de nucléotides. Dans le cadre de la métagénomique, la métatranscriptomique est utilisée pour étudier l'expression génétique des microbes.

Microbiome

La population de bactéries, de virus et de champignons qui peuplent un environnement tel qu'un sol ou un organisme.

Mycélium

Le mycélium est la partie végétative des champignons, constituée d'hyphes, des structures en forme de racines composées de fins filaments. Un mycélium est une masse de champignons constituée d'une masse d'hyphes.

Mycologie

La mycologie est l'étude des champignons. Un mycologue est une personne qui étudie les champignons.

Mycorhizien

Mycorhize signifie "champignon-racine" et fait référence aux racines fongiques et aux relations symbiotiques entre les plantes et les champignons. Les mycorhizes sont des champignons qui vivent dans les rhizosphères des plantes.

Échantillonnage du sol

Le processus de collecte d'échantillons de sol en vue d'une analyse génétique ou chimique. SPUN suit une version modifiée des protocoles Silva Nova/SoilBon que vous pouvez consulter ici.

Gestion des sols

La pratique consistant à prendre soin des sols et à nourrir les communautés microbiennes dans le sol, à prévenir l'érosion et d'autres menaces à la santé du sol, afin que les générations futures puissent bénéficier de la ressource. Le sol est une ressource vivante limitée, dont la formation peut prendre des milliers d'années.

Symbiose et associations symbiotiques

La symbiose est une relation biologique entre différentes espèces. Les associations symbiotiques peuvent être mutualistes (mutuellement bénéfiques), commensales ou parasitaires. Les membres d'espèces différentes en interaction symbiotique sont des symbiotes.

Incertitude

L'incertitude est la quantification de l'inconnu, un processus clé en science. Il est important de quantifier l'incertitude et la façon dont elle se propage à travers notre pile de données jusqu'à nos couches de prédiction afin d'identifier la source de l'incertitude. La recherche SPUN est guidée par l'incertitude, ce qui nous aide à cartographier les écosystèmes les moins explorés de la Terre : à savoir, les environnements et les écorégions qui ne sont pas couverts par notre base de données actuelle, où nos prédictions ont une incertitude élevée, mais ne sont pas uniques sur le plan environnemental, et l'erreur sous-pixel où nous manquons d'informations en dessous de la résolution de notre prédiction.

Explorateurs souterrains

Underground Explorers est un programme par lequel SPUN collabore avec des scientifiques, des chercheurs et des communautés locales pour cartographier les réseaux de champignons mycorhiziens dans leurs écosystèmes respectifs. Cliquez ici pour en savoir plus sur le programme Underground Explorers.