La perte de biodiversité est une perte permanente (extinction) ou réversible de la diversité génétique des êtres vivants dans un écosystème ou une zone donnée. La perte actuelle de biodiversité est en grande partie due aux activités humaines. L'appauvrissement de la biodiversité marine par la consommation (surpêche) ou la destruction des habitats par l'urbanisation croissante en sont des exemples. La déforestation, le travail du sol, les intrants chimiques et la monoculture sont autant d'activités susceptibles d'entraîner une perte de biodiversité dans les sols.