La biodiversité des écosystèmes fait référence aux variations entre les écosystèmes. Un écosystème est constitué de ses organismes, de leur environnement et des interactions entre les deux. La diversité des écosystèmes est l'étude des différents écosystèmes et des différents types de diversité, tels que la variation des espèces, la variation génétique et la variation fonctionnelle.