Sous-ensemble de l'écologie de la restauration ou de la gestion régénérative des écosystèmes, la restauration fongique peut prendre de nombreuses formes. Les principaux objectifs sont la protection et la conservation des populations de champignons et des espèces menacées par la dégradation des sols, ainsi que l'arrêt de la perte de biodiversité. Un autre avantage est de soutenir les nombreux services écosystémiques fournis par les champignons. La restauration fongique peut inclure la restauration des microbes du sol, ce qui entraîne une augmentation de la productivité de la biomasse végétale et aide les plantes à accroître leur résistance aux chocs. Certains services écosystémiques sont importants pour la production alimentaire, tandis que d'autres sont importants pour les écosystèmes et tous leurs habitants. D'un point de vue scientifique, SPUN s'intéresse à l'étude de la manière dont les populations fongiques soutiennent les taux de germination des graines et les taux de croissance et de survie des plantes, pour la régénération, le reboisement et l'afforestation. Les champignons sont des moteurs essentiels de la succession végétale, car ils fournissent les nutriments spécifiques dont une plante a besoin. La restauration fongique est difficile à mesurer. La SPUN prend des mesures en faveur de la restauration fongique en établissant des repères (inventaire à un moment donné) des populations fongiques actuelles.