SPUN Field Update : Connaissances fongiques indigènes + Corse + plus

Notes de terrain

Programme des explorateurs souterrains

En septembre, nous avons ajouté 33 nouveaux bénéficiaires à notre programme Underground Explorers, ce qui porte à 55 le nombre total de subventions accordées. Cette dernière cohorte comprend des chercheurs de régions sous-explorées de la planète, notamment l'Alaska, l'Indonésie, Madagascar et le Brésil. Pour en savoir plus sur leurs projets, cliquez ici.
Un nouvel appel à candidatures sera lancé en février 2024.

Don Talí

À l'occasion de la Journée des peuples autochtones, nous avons diffusé un court métrage réalisé par Mateo Barrenengoa en collaboration avec la Fungi Foundation sur Don Talí, l'un des anciens Mapuches qui a influencé notre travail au Chili. Don Talí vit dans la région de l'Araucanía, où sa famille s'occupe des champignons depuis des générations.

Vous pouvez la regarder ici.

Corse

En septembre, SPUN a échantillonné en Corse, la "montagne dans la mer". Les forêts de haute altitude de la Corse sont considérées comme des laboratoires vivants de la manière dont les écosystèmes anciens réagiront au changement climatique. L'expédition visait à comprendre comment les arbres les plus anciens de la Méditerranée s'associent à des champignons pour survivre à des stress climatiques extrêmes. Nous avons également généré de nouveaux ensembles de données sur les prairies et les arbustes de l'île.

L'expédition a été menée par les docteurs Aurélie Deveau, Francis Martin, Nicolas Suberbielle, Jean-Paul Maurice, Toby Kiers et Merlin Sheldrake, en collaboration avec l'INRAE et le Conservatoire botanique national de Corse. Notre recherche sur le terrain a été le fer de lance d'une technique émergente appelée métatranscriptomique qui utilise l'information codée dans l'ARN fongique pour comprendre la fonction et l'activité des gènes fongiques souterrains à des moments précis dans le temps.

Pour en savoir plus sur cette expédition, consultez l'article de l'Atlantique ci-dessous.

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Projet de l'Institut commun du génome

Nous sommes heureux d'annoncer un nouveau projet, dirigé par les docteurs Adriana Corrales et Bethan Manley, en collaboration avec le docteur Francis Martin de l'INRAE et le docteur Camilo Andres Salazar Clavijo de l'Universidad del Rosario en Colombie pour le Joint Genome Institute.

Les champignons mycorhiziens jouent un rôle crucial dans les fonctions écosystémiques des biomes terrestres. Des ensembles de données génomiques, métabarcodiques et biogéochimiques ont été utilisés pour relier la distribution des espèces fongiques aux fonctions critiques de l'écosystème du sol, telles que le cycle des nutriments. Cependant, ces données ont été largement limitées à l'hémisphère nord. Ce projet vise à comprendre la contribution des champignons ectomycorhiziens (ECM) au cycle des nutriments dans les biomes tropicaux et méditerranéens. Nous espérons générer des données sur le séquençage métatranscriptomique des communautés mycorhiziennes afin d'identifier les processus métaboliques clés et le séquençage du génome des espèces mycorhiziennes représentatives de chacun des deux biomes étudiés.

Ces données permettront d'acquérir une nouvelle compréhension globale des écosystèmes dominés par les champignons ECM et du rôle qu'ils jouent dans le cycle des nutriments et le stress climatique.

Désert d'Atacama

En décembre, les membres de l'équipe SPUN Adriana Corrales, César Marín et Daniela Soto-Hernández mèneront ensemble une expédition dans le désert d'Atacama, en collaboration avec l'unité environnementale du Conseil des peuples Atacameño. Les champignons du désert sont incroyablement peu étudiés, et l'équipe espère découvrir quels sont les champignons qui soutiennent les "oasis de culture" des Atacameños, cultivées depuis des millénaires.

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SPUN dans l'actualité

Aeon - Quand les algues rencontrent les champignons - l'histoire cachée du partenariat le plus réussi de la vie

Aeon présente notre vidéo explicative "Mycorrhizal Fungi : Les racines de la vie sur terre", narrée par Merlin Sheldrake, animée par May Kindred-Boothby, produite en collaboration avec la Fungi Foundation et accompagnée d'une musique de Cosmo Sheldrake.

The Atlantic - La force invisible qui maintient le carbone dans le sol

"Un chasseur de champignons ne cherche pas tant un objet qu'un système, écartant une couche de feuilles humides pour trouver les filaments de soie qui soutiennent le monde. Ces multitudes de fils fongiques ressemblant à des cheveux - appelés individuellement hyphes et collectivement mycélium - constituent le véritable corps des champignons, transportant les nutriments d'un côté à l'autre du sol de la forêt".

The Washington Post - Comment quelques sacs de terre pourraient contribuer à rendre la planète plus résistante au changement climatique

"La steppe kazakhe, qui s'étend du nord de la mer Caspienne aux montagnes de l'Altaï, est l'une des plus grandes steppes sèches du monde et devrait présenter une grande diversité de champignons mycorhiziens. Mais comme la région devient de plus en plus désertique, nombre de ces champignons risquent de disparaître".

Sur notre radar

Livres que nous lisons

Tendances en science végétale "Symbiotic control of canopy dominance in subtropical and tropical forests"
Dans cet article, les auteurs proposent une nouvelle hypothèse basée sur la symbiose pour expliquer la dominance de la famille d'arbres Dipterocarpaceae dans les forêts tropicales et subtropicales d'Asie. Cette hypothèse, appelée "hypothèse vertueuse d'acquisition du phosphore" (VPA), propose que les champignons ectomycorhiziens puissent rapidement coloniser les semis de Dipterocarpaceae et fournir du phosphore acquis directement à partir de sources organiques par l'intermédiaire d'enzymes extracellulaires hautement spécialisées, tout en produisant des rétroactions positives qui pourraient bénéficier à l'hôte ectomycorhizien par rapport aux espèces de plantes mycorhiziennes à arbuscules.

Nature Microbiology "A relational framework for microbiome research with Indigenous communities"
Cet article décrit les pratiques de recherche éthiques pour l'inclusion des communautés indigènes dans la recherche sur le microbiome humain. Nous avons trouvé dans cet article de nombreux parallèles avec le travail mondial sur le microbiome du sol (par exemple, les populations indigènes historiquement absentes de la coproduction des connaissances ou des bénéfices, de l'extraction intellectuelle et matérielle). Le cadre relationnel de l'auteur entre les peuples autochtones, les chercheurs et les microbes aide à clarifier les domaines dans lesquels la recherche éthique sur le microbiome peut être améliorée grâce à une plus grande souveraineté de la recherche autochtone.

New Phytologist "GlobalAMFungi : a global database of arbuscular mycorrhizal fungal occurrences from high-throughput sequencing metabarcoding studies"Les auteurs ont produit une compilation libre de données de séquences d'ADN de code-barres pour les champignons MA, comprenant près de 8500 échantillons avec leurs emplacements géographiques associés et des métadonnées. Nous nous réjouissons de la publication de cette ressource essentielle pour l'étude de la répartition mondiale des champignons MA.

Conférences à venir

Symposium sur les champignons d'Afrique tropicale
10-12 janvier 2024, Parakou, Bénin

11e atelier international annuel sur les champignons mycorhiziens comestibles
22-26 avril, Esquel, Chubut, Argentine

Conférence internationale sur les mycorhizes
4-9 août 2024, Manchester, Royaume-Uni

Congrès international de mycologie
IMC 11-15 août 2024, Maastricht, NL

Travail sur le terrain

Vous souhaitez participer à la recherche sur les champignons ? De nombreux chercheurs mènent actuellement des projets dans divers domaines de la mycologie environnementale. Consultez-les sur notre page "Associés".

Si vous êtes un chercheur sur les mycorhizes et que vous souhaitez devenir un associé SPUN, vous pouvez remplir ce formulaire pour poser votre candidature.

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