Un assemblage de génomes hautement contigus révèle des sources de nouveauté génomique chez le champignon symbiotique Rhizophagus irregularis

La plupart des plantes ont besoin d'aide pour obtenir et absorber les nutriments et l'eau. Nombre d'entre elles obtiennent ce soutien grâce à des relations symbiotiques avec des champignons souterrains appelés champignons mycorhiziens à arbuscules (MA). Si les scientifiques en savent beaucoup sur les bienfaits de ces champignons pour les plantes, ils commencent tout juste à comprendre les gènes et l'ADN des champignons MA. Dans cette étude, les chercheurs ont créé une carte génétique (ou génome) presque complète d'un champignon AM commun appelé Rhizophagus irregularis en utilisant des techniques avancées de séquençage de l'ADN.

Grâce à cette carte génétique, les chercheurs ont identifié des gènes et des schémas d'ADN importants. Ils ont constaté que de nombreux gènes liés à l'entrée et à la sortie des nutriments dans les cellules existaient avant même l'évolution des champignons AM, ce qui montre que ces gènes sont présents depuis exceptionnellement longtemps. Ils ont également découvert de nouveaux gènes qui n'existent que dans ce groupe de champignons. Une autre découverte importante est que des zones de l'ADN ayant récemment évolué produisent de nombreuses petites molécules d'ARN, qui semblent aider le champignon à contrôler ses informations génétiques. Cette carte détaillée permet aux scientifiques de mieux comprendre comment les champignons AM ont évolué pour vivre et se développer en tant que partenaires obligatoires des plantes.