Cette saison a été encore une fois chargée dans le monde souterrain. Nous avons ajouté une nouvelle cohorte de 39 bénéficiaires à notre programme Underground Explorers, terminé l'échantillonnage dans le désert mongol et lancé deux expéditions dans les forêts tropicales humides de Colombie. Nous nous préparons actuellement à effectuer des échantillonnages en Équateur, en collaboration avec le projet More Than Human Life de l'université de New York, la Fondation Fungi et le peuple Kichwa originel de Sarayaku .
Notes de terrain
Programme des explorateurs souterrains
Nous avons ajouté notre plus grande cohorte d'explorateurs souterrains à ce jour. Le 18 juillet, nous avons accueilli nos 39 nouveaux bénéficiaires pour leur séance de lancement. Cette cohorte comprend des explorateurs de 26 pays différents, dont l'Ouganda, l'Ouzbékistan, le Honduras, le Bhoutan, le Maroc et l'Iran. Vous pouvez consulter les nouveaux explorateurs et leurs emplacements de projet ici .
Semaine du climat et Convention sur la diversité biologique à New York
Du 22 au 29 septembre, nous participerons à la Climate Week à New York et à la fin du mois d'octobre, nous assisterons à la COP16 de la CDB en tant qu'observateurs officiels. Si vous participez à l'un de ces événements et que vous souhaitez vous connecter, envoyez un e-mail à hello@spun.earth.
Colombie
En juillet, SPUN, dirigé par le Dr Adriana Corrales, a entrepris une expédition d'une semaine dans les Andes colombiennes pour visiter les forêts nuageuses de Huila et prélever des échantillons parmi les chênes noirs pour étudier les champignons mycorhiziens qui leur sont associés. Le chêne noir colombien est un arbre endémique qui figure sur la liste rouge de l'UICN, et nous souhaitons déterminer la diversité des champignons mycorhiziens qui lui sont associés et identifier les champignons qui pourraient être essentiels à la survie de l'espèce.
Photo : SPUN/Andrés Pacheco - La Cueva Cine Sur le terrain, les échantillons ont dû être transférés dans un récipient rempli d'azote liquide à -196 °C afin que l'ARN présent dans le sol ne se dégrade pas sous la chaleur de la forêt tropicale. De retour au laboratoire, nous utiliserons la métatranscriptomique et le métabarcoding pour mieux comprendre l'identité et la fonction des champignons qui vivent sous terre. Bien qu'il s'agisse de l'une des régions les plus riches en biodiversité de la planète, à notre connaissance, aucun génome de champignon ectomycorhizien tropical n'a jamais été séquencé.
Photo : SPUN/Andrés Pacheco - La Cueva Cine Dans la forêt tropicale, les températures étaient élevées et il y avait des jours de pluies étouffantes et d'orages. Nous avons passé de nombreuses heures à parcourir des chemins de terre pour atteindre les chênes noirs dans leurs endroits isolés préférés, en haut des montagnes. La dernière journée d'échantillonnage s'est terminée par une balade en téléphérique à travers les collines verdoyantes qui produisent certains des meilleurs cafés du monde.
Photo : SPUN/Adriana Corrales Cette étude est soutenue par le Joint Genome Institute et réalisée en collaboration avec la Fondation Franklinia et le Dr Francis Martin de l'INRAE. Au cours de nos excursions sur le terrain, nous avons rencontré des producteurs de café locaux ainsi que des experts locaux travaillant dans le domaine de la conservation. Nous espérons que ce travail contribuera à combler une lacune énorme dans les connaissances mondiales sur le rôle fonctionnel des champignons ectomycorhiziens tropicaux.
Vidéos de cartographie
Vous êtes -vous déjà demandé comment nous élaborons nos cartes ? Vous pouvez en apprendre davantage sur la façon dont nous priorisons les lieux d'expédition, comment nous utilisons l'incertitude pour renforcer nos modèles et comment nous cartographions les menaces qui pèsent sur les champignons sur notre nouvelle page de cartographie .
Recherche et explications
Nous avons lancé une nouvelle section sur notre site Web. Gardez un œil sur notre page Recherche pour rester au courant des dernières publications de notre équipe et des nouveaux articles expliquant notre science et notre impact.
SPUN dans l'actualité
Forbes – « Comment les champignons au Cameroun peuvent-ils aider les agriculteurs ? »
Carole Djeuani, exploratrice souterraine du Cameroun, étudie comment les champignons pourraient être utilisés comme engrais pour améliorer la production végétale des agriculteurs.
Cosmos - « L'incapacité des partenaires fongiques à se déplacer est synonyme de problèmes pour les arbres »
Les arbres pourraient voir leur migration vers des climats plus propices limitée par l’absence de passagers vitaux essentiels à leur survie. Alors que les climats mondiaux évoluent en raison de l’augmentation des températures mondiales due aux émissions de carbone anthropiques, de nombreuses plantes et animaux se déplacent vers des habitats plus adaptés à leur croissance et à leur protection. Mais les arbres semblent mettre plus de temps à effectuer ces changements.
Forbes - « Ces scientifiques se lancent dans une course contre la montre pour trouver des champignons rares au Ghana »
Un groupe international de chercheurs, dont Jacob Ulzen, explorateur souterrain du Ghana, se lance dans une course contre la montre pour découvrir et préserver des espèces de champignons avant qu’elles ne disparaissent à cause de la montée des eaux. L’agriculture est essentielle à l’économie du Ghana : elle représente plus de la moitié de son PIB, 40 % des exportations et environ 4 ouvriers agricoles sur 10 sont des femmes. Les champignons pourraient donc être un élément clé pour aider les agriculteurs et atténuer l’insécurité alimentaire.
Sur notre radar
ICOM12
Nous sommes ravis de participer à l'ICOM12 à Manchester ce mois-ci. Si vous y participez, n'hésitez pas à venir nous saluer sur notre stand et à vous renseigner sur nos t-shirts en édition limitée !
Livres que nous lisons
PeerJ « Infrastructure innovante pour accéder à la diversité fongique brésilienne grâce à l'apprentissage profond » - Chaves et al. ont produit une base de données de 12 894 images de 505 espèces distinctes de macrochampignons du Brésil pour permettre l'identification des champignons basée sur l'apprentissage profond. Ils visent à développer une application mobile dans le but de démocratiser les connaissances fongiques au Brésil.
Données scientifiques « Global Spore Sampling Project : un ensemble de données mondial et standardisé sur l'ADN fongique en suspension dans l'air » - Ovaskainen et al. présentent le Global Spore Sampling Project (GSSP), un vaste ensemble de données open source sur l'ADN fongique provenant d'échantillons de spores collectés dans le monde entier. Le GSSP contient des informations sur la distribution spatiale de plus de 27 000 espèces, ce qui en fait une ressource précieuse pour l'étude de la macroécologie fongique.
New Phytologist « Les champignons ectomycorhiziens du sapin de Douglas retiennent le carbone nouvellement assimilé provenant du hêtre européen voisin » - Audisio et al. ont conçu une expérience pour suivre le partage du carbone dans un réseau ectomycorhizien commun (ECM). Ils ont découvert que les champignons ECM connectés à différents arbres hôtes partagent le carbone entre eux, mais pas avec les arbres récepteurs. Ils montrent également que la quantité de partage de carbone fongique est liée au nombre d'espèces ECM partagées entre les arbres hôtes.
Base de données « EUKARYOME : la base de données de référence des gènes d'ARNr pour l'identification de tous les eucaryotes » - Tedersoo et al. ont rassemblé des données de séquences d'ADNr eucaryotes issues d'études d'ADN environnemental et de bases de données existantes. Eukaryome est une base de données complète contenant des séquences des gènes d'ADNr couramment utilisés SSU, LSU et ITS, et est la première base de données à inclure des séquences qui couvrent ces régions produites par des technologies de séquençage de troisième génération.
Événements à venir
Conférence internationale sur les mycorhizes (ICOM)
6 - 11 août | Manchester, Royaume-Uni
Semaine du climat à New York
22 - 29 septembre | New York, États-Unis
COP16 de la CDB
21 octobre - 1er novembre | Cali, Colombie
Travail sur le terrain
Vous souhaitez participer à la recherche sur les champignons ? De nombreux chercheurs mènent actuellement des projets dans divers domaines de la mycologie environnementale. Consultez-les sur notre page "Associés".
Si vous êtes un chercheur en mycorhizes intéressé à devenir associé SPUN, vous pouvez remplir ce formulaire pour postuler.
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